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Cierto es que yo tambien he leido mucho sobre usar mejor commit en lugar de commitretainig por ese mismo problema de lentitud, pero yo te aconsejaria que revisases código para ver si tienes alguna transaccion que se abre al comienzo de la aplicacion y no la controles y se cierre por si sola al cerrar dicha aplicacion. Lo que comentas parece un problema de transacciones abiertas durante mucho tiempo.
Yo te aconsejaria, si es posible, que cuando tengas el problema de lentitud todos los usuarios cierren la aplicacion y cuando todos esten fuera vuelvan a entrar, si de esa manera ya no existe lentitud yo aseguraria que son transacciones abiertas que no se cierran.
Suerte
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