[[__hector]]

El proceso ASP.NET (o IUSR_NOMBREMAQUINA) no corre en c:\inetpub\wwwroot, aunque ese sea tu root para el webserver (que bien puede ser otro). Puedes, en el webconfig, poner la ruta completa de la base de datos (unidad, directorio(s), nombre de base de datos), o en el momento en el que buscas la cadena de conexion, concatenar la ruta del root de IIS, algo como:

string str = ConfigurationSettings.AppSettings(ConnectionString).Replace("Data Source=", "Data Source " + Server.MapPath("."));