Hola,
No sé yo si tendrá que ver conque "subas" los archivos en modo "texto", en lugar de en modo "binario". Prueba a subir algún archivo de texto y comprueba luego si se "sube" correctamente. Así sabrás que estás subiendo archivos en modo "texto".
Prueba luego a subirlo los archivos en modo "binario", quiero decir, los que ahora te causan problemas. Por otro lado tengo que decir que no nunca utilizé los componentes que mencionas, pero, deben tener algún método,... alguna propiedad, para especificar lo que te digo, el modo en que se suben los archivos.
¡Lo mismo ni es eso, es lo que se me ha ocurrido a bote pronto!
