Hola
¿Es posible ver el código en funcionamiento? La verdad es que me tienes un poco confuso con el código que has enviado.
Asin a bote pronto veo unos cuantos errores:
1. arrayModel no está bien definido, debería de quedar algo tal que asín
Código:
arrayPoblacion['AUDI'] = Array();
arrayPoblacion['AUDI'][1] = new Option('A3', 1 ); // Guardo el nombre y la clave primaria de cada coche
arrayPoblacion['AUDI'][1] = new Option('A2', 2 );
arrayPoblacion['OPEL'] = Array();
arrayPoblacion['OPEL'][1] = new Option('CORSA', 3 );
yo pondría como primer indice del array una número (la clave primaria de la tabla MARCAS) ya que no tengo muy claro si una cadena de texto como indice funcionará bien en todos los navegadores.
2. Es posible que el problema anterior venga dado por un error en el código:
Código PHP:
if( $modelActiva != $rMoldel["marca"] ) { // SOBRA UN "l" es $rModel y no $rMoldel
$modelActiva = $rModel["marca"];
3. El script puedes ponerlo sin problemas dentro de la cabecera.
Y por último, me hace gracia que has hecho un copia a lo bestia del código, veo que has utilizado hasta basura que deje en el código como la marca "F_" que utilizo para identificar una serie de objetos.
Espero que te sirva de ayuda.