Hola, simplemente puedes hacerlo dando click derecho en Mi PC, luego escojes Administración, te vas al Administrador de dispositivos, buscas en DVD/CD-ROM Drives, seleccionas la torre de CD que te hace falta deshabilitar, le das click derecho y seleccionas Deshabilitar... y listo, esa unidad de CD no estará disponible... a menos que un usuario con permisos administrativos la Habilite nuevamente...
Espero que te funcione y te sea de gran utilidad..., un saludo...