Bueno, supongo que dicho virus necesita meterse en el inicio del sistema para poder trabajar (ya sea el Regedit o cualquier otra cosa), por lo que no creo que haya problema, pero habria que estudiar las caracteristicas de dicho virus, como dices que dicho virus es todo un ingenio, pues que no vaya a ser que al ejecutar uno de tus aplicativos se vuelva a activar, aunque la verdad lo veo muy dificil
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