Puedes usar el evento OnCustomDrawItem del TreeView:
Código:
if not (cdsSelected in State) then
case Node.Level of
0: TreeView1.Canvas.Font.Color := clBlue;
1: TreeView1.Canvas.Font.Color := clRed;
2: TreeView1.Canvas.Font.Color := clGreen;
end;
Otra opción para distinguir los niveles podría ser utilizar un icono distinto para cada nivel. Usas el evento OnGetImageIndex para asignar el índice en el ImageList asociado al TreeView adecuado según el nivel (Level) del nodo.
// Saludos