Hola,
Pero de alguna manera tienes que dar salida a los datos. Si este plugin en concreto no admite otra "entrada" que no sea una lista HTML (que luego el plugin convierte en el "Treeview") debe haber algún otro plugin que admita otra entrada, sea en formato XML, JSON o algo. Pero, insisto, de alguna manera tienes que dar salida a los datos. La lista HTML tiene la ventaja de que, en caso de que el usuario no disponga de JavaScript, el "árbol" seguiría existiendo, puesto que se vería como listas "anidadas".
En todo caso estamos hablando de mostrar los datos en el cliente, y tú desde PHP no puedes (hasta donde yo llego) crear un "Treeview", sino que este habrá de crearse en el propio cliente, con JavaScript. Desde PHP podrás enviar los datos oportunos, como digo, pero, no es PHP quien trabaja en el cliente, como sabes, sino que es JavaScript. Por cierto, aquí hay
más ejemplos del mismo plugin: observa que sí que es posible añadir "nodos" en tiempo de ejecución, por decirlo así, para lo que se usará JavaScript, pero, intuyo que nada impedirá requerir datos al servidor...