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Normalmente, el uso de índices es casi imprescindible.
No comentas que motor de base de datos estas utilizando, pero puedo decirte que si no utilizas índices, cuando haces un JOIN de tablas (consuta sobre varias tablas relacionadas), el uso de índices hace que sean consultas rápitdas. De otro modo, puede llegar a tardar una eternidad.
Los índices no te darán más velocidad en las inserciones de datos. Solo lo notarás cuando tengas que buscar algún datos.
Sin índices, el motor da base de datos lee todos los registros de una tabla y luego devuelve los que correspondan, con índices, solo leerá los datos que deba devolver.
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