Creo crandel que estas confundido, mientras no se cierre el socket todo lo que envies por el sera recibido en el otro extremo en el mismo orden que lo mandaste, esa es precisamente la diferencia entre un protocolo como TCP y uno como UDP. Otra cosa es que hagas envios abriendo y cerrando sockets, en ese caso no tendrian porque llegar en ningun orden en concreto (tampoco tendria mucho sentido hacerlo asi).
Es mas el protocolo FTP no lo conozco en profundidad, pero el HTTP si, y en este ultimo cuando se envia un fichero (imganes, zip, el mismo texto html) se envia todo junto si ningun otro control en el flujo de datos que el propio TCP que esta por debajo del HTTP. Si como tu dices el protcolo TCP no se encargara de controlar el orden en que llegan los datos a estas alturas la web seria un caos
