Usa el evento OnBeforePrint del control y cambia la propiedad memo.text del control usando la función format, algo así (no tengo fastreport a la mano asi que me puedo equivocar en la sintaxis)
Código Delphi
[-]
control.memo.text := format('%.12d', [ < dataset."numero" > ]);
si no funciona eso crear una función que concatene ceros hasta que el valor tenga una longitud de 12 (era la forma que usaba yo)
saludos