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Ten en cuenta que las BD estan pobremente optimizadas para manejar archivos.... su fuerte son los datos RELACIONALES no los no estructurados.
Hay dos caminos realistas. Uno, es simplemente delegar al sistema de archivos, que sera mas o menos tan bueno como el que tenga el sistema operativo. Si desean hacer una busqueda fulltext, deben anexar un motor de indexacion.
Otra, es usar una base de datos no relacional como CuchDB u otra similar. En ese caso no tengo mucha experiencia pero para darte una idea, es masomenos como lo hace google...
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