Bueno, pues le he dado muchas vueltas y no logro entender el porqué de este comportamiento, aunque al parecer he encontrado una forma de solucionarlo:
1. Tal como tienes tu proyecto, borra la referencia al MainMenu en la propiedad Menu del formulario. Esto en el inspector de objetos.
2. En el evento OnCreate del formulario haz la asignación manualmente:
Código Delphi
[-]
procedure TForm1.FormCreate(Sender: TObject);
begin
Menu := MainMenu1;
end;
Prueba a ver si te funciona.
// Saludos