Se me ocurre que con un case puedas encontrar una solucion a tu caso...
a ver debes hacer conteo uno a uno de los hombres y mujeres que están en un departamento e inscritos en determinado año.
entonces un par de case algo así
Código SQL
[-]
--Mujeres
(CASE
WHEN sexo = 'F' THEN 1
ELSE 0
END) as mujeres
-- Hombres
(CASE
WHEN sexo = 'M' THEN 1
ELSE 0
END) as hombres
Si haces una consulta simple usando los case arrojarian unos resultados como estos
DPTO__MUJERES_HOMBRES
Tarija__1__0
Tarija__0__1
Tarija__1__0
Tarija__1__0
Tarija__1__0
Tarija__0__1
Tarija__1__0
Tarija__1__0
(Hay mas mujeres que hombres


)
si a la misma consulta le haces SUM a cada una de las columnas tendras los totales por DPTO y/o AÑO
es solo una idea...