[Casimiro Noteví]

Pues entonces te vale lo dicho antes, en la BD debes de tener una tabla de instituciones y otra de usuarios de las instituciones, básicamente algo así:

Código SQL [-]
tabla tbInstituciones (
  id integer not null,
  nombre varchar(64),
  ...
  primary key (id)
)

tabla tbUsuarios (
  id integer not null,
  id_institucion integer not null,  /* esta es la institución al que pertenece el usuario */
  nombre varchar(64),
  password varchar(64),
  ...
  primary key (id),
  foreign key (id_institucion) references tbInstituciones (id)  /* clave foránea a la tabla tbInstituciones */
)