Para eso sólo has de usar el parámetro adecuado en gbak
Cita:
-SE[RVICE] <servicename>
This switch causes gbak to backup a remote database via the service manager. This causes the backup file
to be created on the remote server, so the path format and filename must be valid on the remote server. The
servicename is currently always the text
service_mgr
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También puedes hacer una búsqueda por los foros, es un tema tratado en diversas ocasiones.