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Habría que estudiar bien el caso para afinar lo más posible.
De todas formas, la mayor o menor velocidad en responder una consulta sql no depende básicamente de que tengas más o menos millones de registros, porque para eso son los índices, casi no importa la cantidad de registros.
Ya digo, habría que estudiar muy bien tu sistema. El cuello de botella puede estar en cualquier sitio, software, hardware, red, internet... no podemos saberlo si no lo podemos verificar,
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