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Cuando manejas esos volumenes debes comenzar a dar mas importancia a todos los detalles, desde la forma como construyes un select, por ejemplo: el orden de las tablas, de los campos, las llaves que utilizas... no solo de los indices.
Debes ademas hacer tunning al motor, revisar el canal y el servidor. Normalmente una empresa que maneja estas transacciones debe contemplar una infraestructura que lo soporte(datacenters, cloud..)
Y de tu parte queda ademas, revisar si estas haciendo consultas desde un cliente difectamente, o si el trabajo duro de las consultas se hacen en el servidor
Por otro lado, debes pensar de una vez en la posibilidad de partir o distribuir tu db, para que solo maneje la transaccionalidad critica y las consultas historicas se hagan hacia un repositirio diferente.
Debes calcular el crecimiento a un año como minimo, y como se haria el ba,ckup y fraccionamiento anual.
En fin
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