Por si a alguien le interesa, al usar:
SHOW TABLE STATUS LIKE 'tabla'
devuelve un campo "update_time" con el tiempo en el que se modificó la tabla la última vez. Funciona correctamente excepto si reparas las tablas porque marca la tabla como actualizada aunque no haya reparado nada. De todas formas, es un mal menor.
PD: a ver si aprendo a poner etiquetas del foro, que eso de poner todo seguido no me gusta...