Cita:
Empezado por Irreo
Lo de que esté todo en una línea o no creo que no afecta.
Yo probaría a:
- Pasar ambos ficheros por un "minify" para dejarlos ambos sin saltos de línea ni tabuladores.
- Pasar ambos ficheros por un "prettify" para ponerlos bien formateados.
Y en cualquiera de los casos, usar un comparador online, o bien usando tu GIT local, ver qué diferencias hay.
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Yo entiendo que sí puede afectar si el "minify" se realiza sobre un XML
ya firmado.
La firma del XML debe ser lo último que se haga antes de grabar el fichero, ya que cualquier cambio posterior la invalidaría.