Un OT con su Nif puede estar dado de alta en diferentes regímenes fiscales y por ende, puede tener bajo su mismo Nif, una estación de servicio bajo el régimen general, una tienda minorista bajo el régimen de recargo de equivalencia y una empresa de alquileres de coches. Todas pertenecen al mismo OT con el mismo Nif y cada una con su nombre comercial particular. Debido a esta tesitura, si el OT compra un software de facturación multiempresa, lo más probable es que defina las tres empresas por separado ya que ni los productos ni los impuestos son aplicables a las tres de la misma forma.
Es por eso, que te comentaba que teniendo en tu sistema el mismo SIF para todos, no te queda otra que encadenar en una sola línea de facturación las tres empresas de este OT.
Tienes razón en que la frase
"Siempre debes encadenar con el último RF generado por tu SIF" no se puede generalizar, pero se sobreentiende que cuando dices esto es porque ese SIF sólo tiene un OT.
Aunque te podría responder lo mismo, cuando dices
"se encadena con el último "registro de facturación" (del mismo NIF) generado", para tu sistema sí pero para el resto donde un OT puede tener diferentes SIF's no sería correcto.
Al final, lo que debemos dejar claro para la gente que anda buscando información es remitirnos a lo que dice el reglamento, y sus Faq's lo deja bien claro
¿En qué consiste la trazabilidad exigida a los sistemas informáticos de facturación (SIF) en el reglamento y la orden «de requisitos de los SIF»?
La trazabilidad se refiere a que se pueda garantizar (y, en su caso, detectar) que no hay “huecos” o “saltos” en la secuencia de generación de los registros de facturación (RF) correspondientes a las facturas expedidas utilizando un determinado SIF de un obligado tributario (OT), así como que dicha secuencia se corresponde con la de la fecha y hora de generación empleadas. Esto se consigue “encadenando” los RF generados por cada SIF del OT, es decir, formando virtualmente una “cadena”.....
https://sede.agenciatributaria.gob.e...recuentes.html