[espinete]

Al final he conseguido generarlo de esta manera:

<TipoDesglose xmlns="https://www2.agenciatributaria.gob.es/static_files/common/internet/dep/aplicaciones/es/aeat/ssii/fact/ws/SuministroInformacion.xsd">
<DesgloseTipoOperacion>
	<Entrega>
		<Sujeta>
			<Exenta>
				<DetalleExenta>
					<CausaExencion>E6</CausaExencion>
					<BaseImponible>100.00</BaseImponible>
				</DetalleExenta>
			</Exenta>
			<NoExenta>
				<TipoNoExenta>S1</TipoNoExenta>
				<DesgloseIVA>
					<DetalleIVA>
						<TipoImpositivo>21.00</TipoImpositivo>
						<BaseImponible>100.00</BaseImponible>
						<CuotaRepercutida>21.00</CuotaRepercutida>
					</DetalleIVA>
				</DesgloseIVA>
			</NoExenta>
		</Sujeta>
	</Entrega>
</DesgloseTipoOperacion>
</TipoDesglose>

He leído que una factura NO puede contener ambos bloques juntos DesgloseFactura y DesgloseTipoOperacion, así que he optado por usar DesgloseTipoOperacion cuando se trate de facturas raras como esta.