Depende del presupuesto que tengas.
Existen dos productos en el mercado para hacerlo:
- Relativity
http://www.liant.com/
- Cobol Access +
http://www.rldt.fr/index.htm
Ambas herramientas son de pago.
Si es un traspaso de datos puntual, que se va a efectuar una única vez, lo mejor y mas económico es traspasar los datos cobol a un fichero ASCII y desde ahi pasarlos a tu base de datos.