No comentas qué tipo de Base de Datos estás utilizando. Si es de escritorio, normalmente se pueden comprimir con alguna livbrería ZIP. Últimamente utilizo
ZipMaster y funciona bien. Si se trata de Access no estaría de más hacer una compactación de la Base de Datos antes de comprimirla; En
éste truco del club tienes cómo hacerlo.