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Tiene que ver con muchisimas cosas, y es que de nada te sirve traducir un codigo pin pum de win32 a .NET si no vas a utilizar las caracteristicas de .NET primeramente, y segundo si no sabes cuales son las mejores practicas al momento de programar en .NET (con respecto a que clase hace mejor que trabajo en que situacion, ej. dataadapters vs datareaders), concatenacion de caracteres, y bla bla bla.
Intrinsecamente no va mas lento, o al menos no tan lento que puedas percibirlo. No influye mucho el runtime de .NET, y para constatar ese punto basta con ver que el engine de Quake II fue portado a .NET (Quake II.NET), y se hicieron muchos benchmarks en los que a .NET no les fue nada mal (todos sabemos que no hay nada que consuma mas procesamiento que un juego, y mas de ese tipo)
Creo que es hora de que te replantees el diseño de la app
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Héctor Geraldino
Software Engineer
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