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Transacciones en el limbo no vas a tener a no ser que uses transacciones en dos fases, que se preparan primero con prepare y que se utilizan cuando hay implicada más de una base de datos en la transacción.
Tu asegurate de que en las aplicaciones de los clientes se están cerrando debidamente las transacciones.
Un sweep lo puedes hacer cuando quieras, preferentemente cuando menos clientes tenga conectado el servidor para no ralentizar. Utiliza la herramienta de consola gfix tal que asi:
gfix -sweep basededatos -user SYSDBA -password password
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Milo
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