Cronometro

[Fate]

El problema es que quieres iniciar un date en 00:00:00 ?

Si es así pues le das un SetHour y los otros dos setteres(minutos y segundos y listo)

Lo otro que entiendo es que quieres darle formato de 24 y no de doce horas, si es asi pues yo uso esto:

Date d = new Date();
    DateFormat df = new SimpleDateFormat("HH:mm:ss:SSS");
    System.out.println("Starting task " + id + " at " + df.format(d));

y obtengo esto:

Starting task Task 3 at 13:10:10:328


Espero quede hyperaclarado o yo haya entendido bien