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Hay alguna forma de indicarle a MySQL que lea de otro directorio las base de datos, y esto claro haciendolo desde los componentes Zeos.
La respuesta corta es no.

La respuesta larga es que no necesitas tal cosa. Piensa que aun cuando planees colocar las tablas en la misma pc que la aplicación, éste no es el esquema usual en una aplicación cliente-servidor. En este punto el BDE y MySQL difieren radicalmente. El BDE te da acceso a bases de escritorio, es decir, bases -justamente- que viven (a grandes rasgos) en el mismo ordenador que el ejecutable, mientras que con MySQL, tus bases se encuentran en un ordenador externo al que accedes mediante una IP. Detrás de esa IP puede haber un sistema Windows, Unix, etc., cada cual con su propio sistema de archivos; pero nada de eso importa a las aplicaciones externas, pues ni siquiera tienen acceso directo a esos archivos, sólo al servidor en sí de MySQL.

El hecho de que coloques el servidor de MySQL en el mismo ordenador, no cambia la situación, es sólo una cuestión geográfica; el acceso a las tablas sigue siendo a traves de una IP, aún siendo una IP "local" como 127.0.0.1 (también conocida como localhost).

De hecho, tienes que considerar que el servidor de MySQL y tu aplicación, son dos cosas distintas, tu aplicación ni siquiera tendría que ocuparse de instalar el servidor, sólo de ejecutar los scripts necesarios para crear la base y sus tablas.

Dicho de otra forma: tu aplicación simplemente va a hacer uso de un servicio ya existente, y es este servicio (MySQL) el que decide dónde colocar las bases de datos.

-------------------

Ahora bien, si aun después de lo dicho, insistes en querer colocar tus tablas en tus directorios, puedes optar por usar MySQL embedded, que no es otra cosa que una copia del servidor MySQL incrustada en tu aplicación, que sólo tu aplicación verá y que, aquí sí, puedes definir su propio directorio de datos.

Toma en cuenta, no obstante, que si -como mencionas- puede haber varias aplicaciones en el mismo ordenador accediendo a bases de MySQL, no tiene caso duplicar recursos incrustando una copia en cada aplicación.

// Saludos
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