Recomendación para aplicación intranet

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No todo se puede pasar a web y no todo se puede mantener igual!

Para un proyecto de este tipo se debe planear para no caer en errores que luego nos harán aplicar la estrategia que no quisimos abarcar desde el principio. Cosas como formularios simples, captación de solicitudes, edición de contactos, tec... pueden estar perfectamente en una aplicación web o en un dispositivo movil; Pero algunos procesos importantes para el negocio mejor es que estén en un entorno mas controlado como un aplicativo de escritorio. Hacer esta planeación y determinar no solo que irá en un lado u otro sino también establecer las formas de comunicación entre las n plataformas hará que los procesos lleguen a ser mas efectivos.

Cambiar de entorno o de lenguaje, pues depende de la tecnología o la combinación de las mismas que elijas. Puede que una web en .Net o PHP + Servicios Web escritos en .Net, PHP o Delphi y un app en delphi sea una buena opción para trabajar.

Y si!. Además a esto puedes agregarle conexiones VPN o de escritorio remoto con VNC o Terminal Server como ya te ha aconsejado Casimiro.