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AzidRain Va camino a la fama
Me adhiero a Román, lo más sencillo y recomendable es usar mysqldump. Yo le agregaría conjuntarlo con algún compresor de archivos tipo zip o 7zip (mas recomendable). En el caso de linux puedes usar tar y luego gzip. Al ser el archivo generado por mysldump un simple texto plano, se alcanzan niveles de compresión muy buenos.

Hacerlo de esta forma esta sencillo que basta hacer un pequeño archivo .BAT (windows) o script bash (linux) para realizar todo el respaldo completo de cualquier base de datos que necesites. Después solo lo agregas al programador de tareas (win) o al cron (linux) y tienes configurado y listo un respaldo diario sin ningún problema.
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AKA "El animalito" ||Cordobés a mucha honra||
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