TICKET BAI (TicketBAI); Nuevo sistema de la Agencia Tributaria del Pais Vasco

[Sanduzelai]

Buenos días,
lo primero es daros las gracias a todos por toda la información tan útil que habéis compartido (menos mal que existe este foro!).

Me encuentro en el punto de firmar el archivo XML para después enviarlo a la administración.
Tengo un certificado .pfx de Representante de Persona Jurídica (entiendo que es uno de los válidos) y quiero instalarlo en un servidor CentOS. La idea es que una vez hecho esto, el programita en java que estoy desarrollando obtenga el certificado y firme los XML que después enviará.

¿Alguien sabe como tengo que "instalar" ese certificado en mi servidor linux CentOS? ¿O con copiar el .pfx en una carpeta del servidor y poner esa ruta al java (para que este lo recoja y firma los XML) sería suficiente?
La verdad es que no he trabajado nunca con certificados y estoy super perdido.

Por otro lado he leído por aquí que se recomendaba utilizar Chilkat.
He ojeado un poco su api y tiene buena pinta pero ¿conocéis alguna librería java gratis como alternativa a chilkat para este fin?


Muchas gracias por adelantado