¿Cómo creo un archivo de inicio una vez he finalizado mi aplicación?

[islu]

El problema esta en que no has insertado los archivos, si ves en la pestaña de [Groups] debería poner algo como esto :

[Groups]
Groups=4
Group1Size=8
Group1Files=1
Group1Name=Program Files
Group1Dir=<INSTALLDIR>
Group1Update=0
Group1TargetOS=-1
Group1File1=C:\ISLU.EXE
Group2Size=7145114
Group2Files=25
Group2Auto=101
Group2ID=38701
Group2Name=BDE/IDAPI Files
Group2Dir=<ProgramFilesDir>\Common Files\Borland Shared\BDE
Group2Update=-1
Group2TargetOS=-1
Group2File1=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\IDAPI32.DLL
Group2File1Auto=101
Group2File2=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\IDR20009.DLL
Group2File2Auto=101
Group2File3=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\BLW32.DLL
Group2File3Auto=101
Group2File4=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\BDEADMIN.EXE
Group2File4Auto=101
Group2File5=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\BDEADMIN.HLP
Group2File5Auto=101
Group2File6=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\BDEADMIN.CNT
Group2File6Auto=101
Group2File7=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\BDEADMIN.TOC
Group2File7Auto=101
Group2File8=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\IDDR32.DLL
Group2File8Auto=101
Group2File9=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\IDPDX32.DLL
Group2File9Auto=101
Group2File10=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\IDSQL32.DLL
Group2File10Auto=101
Group2File11=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\IDBAT32.DLL
Group2File11Auto=101
Group2File12=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\IDQBE32.DLL
Group2File12Auto=101
Group2File13=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\IDDBAS32.DLL
Group2File13Auto=101
Group2File14=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\IDASCI32.DLL
Group2File14Auto=101
Group2File15=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\IDODBC32.DLL
Group2File15Auto=101
Group2File16=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\IDDA3532.DLL
Group2File16Auto=101
Group2File17=C:\ARCHIV~1\INSTAL~1\EXPRES~1\redist\IDAPINST.DLL
Group2File17Auto=101
Group2File18=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\BANTAM.DLL
Group2File18Auto=101
Group2File19=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\USA.BTL
Group2File19Auto=101
Group2File20=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\EUROPE.BTL
Group2File20Auto=101
Group2File21=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\CEEUROPE.BTL
Group2File21Auto=101
Group2File22=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\JAPAN.BTL
Group2File22Auto=101
Group2File23=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\OTHER.BTL
Group2File23Auto=101
Group2File24=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\FAREAST.BTL
Group2File24Auto=101
Group2File25=C:\Archivos de programa\Archivos comunes\Borland Shared\BDE\CHARSET.CVB
Group2File25Auto=101
Group3Size=6080
Group3Files=1
Group3Auto=98
Group3ID=38698
Group3Name=BDE/IDAPI CNF File
Group3Dir=<ProgramFilesDir>\Common Files\Borland Shared\BDE
Group3Update=-1
Group3TargetOS=-1
Group3File1=C:\ARCHIV~1\INSTAL~1\EXPRES~1\redist\IDAPI.CNF
Group3File1Auto=98
Group4Size=183808
Group4Files=1
Group4Auto=58
Group4ID=38658
Group4Name=System Files - WinSysDir
Group4Dir=<WINSYSDIR>
Group4Update=-1
Group4TargetOS=-1
Group4File1=C:\WINDOWS\system32\BDEADMIN.CPL
Group4File1Auto=58
[..]

Como verás he insertado el bde y un exe llamado ISLU.EXE.

En el tuyo no hay nada :
[..]
[Groups]
Groups=1
Group1Size=0
Group1Files=0
Group1Name=Program Files
Group1Dir=<INSTALLDIR>
Group1Update=0
Group1TargetOS=-1
[..]

No se que te puede haber pasado. Si quieres mandame el exe y los 2 ficheros que dices que usa por mail, y te genero una instalación para que te sirva de ejemplo ...